Компания Thermo Fisher Scientific, ведущий производитель ПЦР-систем и диагностических наборов для молекулярной диагностики, разработала набор TaqPath™ COVID-19 CE-IVD RT-PCR Kit для качественного определения (скрининга) нуклеиновой кислоты коронавируса SARS-CoV-2 методом полимеразной цепной реакции с обратной транскрипцией в реальном времени (RT-PCR). Набор TaqPath™ содержит все необходимые реагенты и контрольные образцы для анализа 1000 проб, полученных при взятии мазка из носа, носоглотки и/или ротоглотки, промывных вод бронхов, полученных при фибробронхоскопии (бронхоальвеолярный лаваж), а также аспирата из носоглотки.
Положительные результаты свидетельствуют о наличии РНК SARS-CoV-2. Для определения статуса инфекции необходима клиническая корреляция с историей болезни пациента и другой диагностической информацией. Положительные результаты не исключают бактериальной инфекции или сопутствующей инфекции, вызванной другими вирусами. Обнаруженный агент не может быть однозначной причиной заболевания. Набор TaqPath™ COVID-19 CE-IVD RT-PCR не может исключать заболевания, вызванные другими бактериальными или вирусными патогенами.
Ложноположительные результаты могут возникнуть по следующим причинам:
- Перекрестная контаминация во время обработки или подготовки образца
- Перекрестная контаминация между образцами пациентов
- Смешение образцов
- Контаминация РНК во время обработки
Отрицательные результаты не исключают заражение SARS-CoV-2 и не должны использоваться в качестве единственной предпосылки для принятия решений по ведению пациентов. Отрицательные результаты должны сочетаться с клиническими наблюдениями, историей болезни и эпидемиологической информацией.
Ложноотрицательные результаты могут возникнуть по следующим причинам:
- Неправильный сбор образцов
- Разрушение вирусной РНК во время транспортировки/хранения
- Неэффективный метод выделения
- Наличие ингибиторов ПЦР
- Мутация в вирусе SARS-CoV-2
- Несоблюдение инструкции по эксплуатации
Набор TaqPath™ COVID-19 CE-IVD RT-PCR Kit имеет регистрационное удостоверение Министерства Здравоохранения РФ РЗН 2020/12627 от 19.11.2020.
Состав набора TaqPath™ COVID-19 CE-IVD RTPCR Kit:
Набор TaqPath™ COVID-19 RT-PCR рассчитан на 1000 реакций (анализов). Срок годности набора – 12 месяцев.
В состав набора входит:
|
Компонент |
Назначение |
Количество |
Объем на пробирку/ флакон |
|
TaqPath™ COVID-19 Assay Multiplex |
Мультиплексная тест-система, содержит три набора праймеров/зондов Gene ORF1ab, N Protein, S Protein, специфичных для различных геномных областей SARS-CoV-2, и праймеры/зонды для бактериофага MS2 |
1 пробирка |
1500 мкл (на 1000 реакций) |
|
MS2 Phage Control |
Контроль РНК для проверки эффективности подготовки образца и отсутствия ингибиторов в реакции кПЦР |
10 пробирок |
1 мл |
|
TaqPath™ COVID-19 Control |
Контроль РНК, содержит мишени, специфичные для геномных областей SARS-CoV-2 |
10 пробирок
|
10 мкл (1 x 104 копий/мкл) |
|
TaqPath™ COVID‑19 Control Dilution Buffer |
Буфер для разведения |
10 пробирок |
250 мкл |
|
TaqPath™ 1 -Step Multiplex Master Mix (No ROX™) |
Для активации и анализа РНК (без красителя) |
1 флакон |
10 мл |
Особенности набора TaqPath™ COVID‑19 CE‑IVD RT‑PCR Kit:
Гибкость. Набор совместим с различными типами образцов и рассчитан на использование с широким диапазоном объемов вводимого образца.
Высокая специфичность. Выявление трех типов генов SARS-CoV-2: ORF1ab, белок N, белок S. В объединенные в пул отрицательные по SARS-CoV-2 мазки из носоглотки и бронхоальвеолярные смывы вносились потенциально мешающие вещества, такие как кровь человека, антибиотики, антибактериальные и противоаллергенные препараты, вирус гриппа A H1N1. Каждое вещество исследовалось в трех экстракциях. Ложноположительные результаты не были получены ни для одного из веществ. Виртуальный анализ на 43 микроорганизма (коронавирус MERS, аденовирус, вирусы гриппа и парагриппа, энтеровирус и другие) для проверки перекрестной реактивности показывает, что вероятность значительной амплификации нецелевых последовательностей, приводящей к перекрестной реактивности или могущей помешать детекции SARS-CoV-2, отсутствует.
Чувствительность. Порог чувствительности 10 копий/реакция для образцов мазков из носоглотки и бронхоальвеолярных смывов объемом 400 мкл.
Автоматизация. Использование специализированного программного обеспечения для автоматической интерпретации результатов анализа на SARS-CoV-2 устраняет «человеческий фактор» и позволяет снизить риск ошибок интерпретации.
Оперативность. Результаты для 94 образцов могут быть получены менее чем за 3 часа. Для 382 образцов – менее чем за 6,5 часов (при использовании одной RT-PCR- системы).
Клиническая эффективность набора TaqPath™ COVID-19 CE-IVD RT-PCR Kit:
Проводилось исследование клинической эффективности с целью оценки рабочих характеристик TaqPath™ COVID-19 CE-IVD RT-PCR Kit применительно к мазкам из носоглотки и бронхоальвеолярным смывам. Было исследовано в общей сложности 60 искусственно созданных положительных образцов с различной конечной концентрацией РНК. Количество положительных результатов составило 100 %. Помимо искусственно созданных положительных образцов, исследовалось 60 отрицательных образцов. Для всех отрицательных проб были получены отрицательные результаты.
Необходимое оборудование для использования набора TaqPath™ COVID-19 CE-IVD RT-PCR Kit:
- Прибор для ПЦР в реальном времени
- Центрифуга с ротором для микропланшетов
- Микроцентрифуга
- Лабораторная морозильная камера с диапазоном рабочих температур от - 30°С до - 10°С
- Лабораторная морозильная камера с рабочей температурой не выше - 70°С
- Лабораторная вихревая мешалка
- Одноканальные и многоканальные пипеточные дозаторы переменного объема (от 1 мкл до 1000 мкл)
- Охлаждаемый блок (96-луночный или 384-луночный)
